板式换热器的水垢是由于水中含有钙镁盐类，在长期使用后光洁的板片上难免会有水垢聚集细菌滋生，析出的结晶盐聚集附着在板片上形成水垢。水垢附着在板片上，影响板片的换热效果，同时加大流通阻力，严重时甚至堵塞流通截面等严重问题。因此，必须要定期清洗水垢，常用的清洗方法是化学清洗杀菌法。除了定期清洗外，平时可以适当加入缓蚀阻垢剂来保养，或者可以采用磁化及离子棒防垢处理以及钠离子交换处理等方法，让换热器保持良好的状态，达到换热效果。